中国仓协于2011年11月成立保税仓储分会，于2018年11月将保税仓储分会更名为保税与海外仓分会，又于2021年10月新成立跨境电商与海外仓分会。这2个分会是中国仓协服务于我国外贸（进出口）领域、推动国际物流发展的行业性分支机构，并与国际仓储与物流联盟（IFWL）秘书处合署办公，由一个专业化的秘书处团队统筹执行3个机构的任务。

  保税与海外仓分会，主要面向保税物流、公共海外仓领域发展会员，重点推动保税仓与海外仓的联动、推动跨境供应链的综合服务体系建设。

  跨境电商与海外仓分会，主要面向跨境电商平台、跨境电商进出口企业与各类海外仓企业发展会员，重点推动海外仓企业与跨境电商综试区的对接，促进中小跨境电商企业与公共海外仓的对接。

  国际仓联秘书处，主要面向各国发展协会会员与企业会员，制订国际标准，建立国际云仓平台，推动仓储资源的全球共建共享。

  分会的宗旨：根据中国仓储与配送协会章程与分会管理办法，在政府有关部门的指导下，促进国家相关政策法规的贯彻实施，推动保税物流与公共海外仓的健康发展，推动海外仓与跨境电商协调融合发展，促进保税仓、海外仓与国际物流的联动发展。

  （一）宣传贯彻国家相关政策法规，开展行业调研，分析行业现状，就促进保税物流、跨境电商与海外仓的发展，提出政策建议；

  （三）组织相关培训和研讨，促进海关监管仓、保税仓、海外仓的运营模式、管理方式与服务功能的创新；

  （四）组织开展行业交流，推广先进技术与成熟模式，推动企业之间的资源整合与业务合作；

  （五）承接政府部门的交办事项，与政府相关部门沟通协调，帮助会员单位解决生产经营中可能遇到的问题。

  在工作方式上，3个机构可以分别组织活动，也可以联合对外开展活动、联合署名；2个分会的会员都是协会的会员，可以不分彼此、交叉参加活动、同时享受服务，统筹协同推动各项工作。